1. Bentuk rubik menggambarkan bidang ilmu dan lomba OSN yaitu Sains.
2. Bentuk rubik juga mengandung makna bahwa meskipun para peserta berjuang dengan cara berbeda dan memiliki konsentrasi ilmu yang berbeda, namun semuanya tetap memiliki satu tujuan yang sama yaitu meraih kesuksesan dan mengharumkan nama Bangsa Indonesia di dunia.
3. Setiap sisi rubik menggambarkan huruf awal dari kata OLIMPIADE SAINS NASIONAL yaitu huruf O di sisi atas, S di sisi kiri dan N di sisi kanan.
4. Perbedaan bentuk dan warna di setiap sisi yang ada mengandung makna keberagaman dari peserta yang tidak hanya berasal dari satu daerah saja, melainkan berasal dari seluruh daerah di Indonesia.
5. Warna merah, biru dan abu-abu menggambarkan jenjang pendidikan dari peserta OSN yaitu SD, SMP, dan SMA.
